Для каждого инжектированнного канала есть свой отдельный регистр данных. А вобще, мой совет не заморачивайся, используй несколько регулярных + DMA и складывай их в буфер. Мечта, а не реализация, ни заморочек, ни проблем.
После праздников выложу материал "Как правильно подключить библиотеку стандартной периферии к любому семейству STM32" .... Где-то на форуме обещал уже ...
На странице "Разработчику" добавлен обещанный материал [iurl=http://www.promelec.ru/support/story/cpu/]"Стандартная периферия STM32"[/iurl]