STM32F1 под STM32F4

Подскажите пожалуйста ,как "заточить" ?

Есть разница в питании (несколько выводов)
Есть разница в библиотеках. Функции стандартной библиотеки похожи по названиям и структуре, но могут отличаться.
Если вы "рулите" непосредственно регистрами (или ещё хуже - адресами периферии) - то переход будет сложнее.

При хорошем программировании, а именно, разделении ПО на уровни - поменять уровень управляющий железом - дело нескольких часов (для программ любой сложности).

Спасибо за ответ Денис ,как я понял нужно перелапачивать  библиотеки  

Да.
Сравнить вызываемые функции стандартных библиотек. Там где разное - поправить.